经济适用房的房产证和商品房的房产证不一样。分析说明：从法律角度来看，经济适用房属于保障性质的住房，其产权证上会明确标注为“经济适用房”，且产权有限。而商品房的产权证则无特殊标注，表示的是普通住宅，拥有完整的房屋所有权，包括使用权、占有权、处置权和收益权。此外，经济适用房在出售时需要缴纳土地出让金，而商品房则不需要。提醒：如果经济适用房的房产证上未标注为“经济适用房”，或者标注信息与实际不符，可能涉及产权纠纷，应及时寻求专业人士的进一步解决。
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处理方式分析：从法律角度来看，经济适用房和商品房的房产证在处理上主要有以下区别：经济适用房的房产证在转让、出租或赠与等方面受到一定限制，而商品房的房产证则拥有更自由的处置权。选择不同处理方式时，应考虑个人需求、法律规定以及可能涉及的费用和风险。对于经济适用房，应遵守相关管理办法，如《经济适用住房管理办法》的规定；对于商品房，则可依据《物权法》等相关法律法规进行自由处置。
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具体操作如下：1. 经济适用房房产证：在购买经济适用房后，购房者会获得房产证和土地证，但产权有限。根据《经济适用住房管理办法》，购买经济适用住房不满五年，不得直接上市交易。如需出售，需按经济适用房所在地标定地价的10%交纳土地出让金（无标定地价时，按房屋售价的3%交纳）。办理完产权过户手续后，购买人所得到的就是普通商品房的产权证书。2. 商品房房产证：商品房的产权证书拥有完整的房屋所有权，包括使用权、占有权、处置权和收益权。在不违反法律规定的情况下，可以自由转让、出租或赠与，不受任何单位或个人的限制和干涉。购买人除税费外，不需要交其他费用。在处理经济适用房和商品房的房产证时，应明确各自的法律规定和限制条件，确保合法合规地进行相关操作。