非农业人员取得集体土地使用证不合法。依据《土地管理法》，集体土地应由农村集体经济组织或村民委员会申请使用，非农业人员无权取得。若不及时处理，可能导致土地权益纠纷，甚至引发法律诉讼。
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常见处理方式为申请撤销或更正土地使用证。若涉及非法转让，还需追究法律责任。选择处理方式时，应根据具体情况，如是否涉及欺诈、非法交易等，决定是采取行政途径还是法律手段。
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应撤销或更正。具体操作：1.收集证据，证明非农业人员取得集体土地使用证的情况；2.向土地管理部门提出撤销或更正申请，并提交相关证据；3.如管理部门不予处理，可依法提起行政诉讼；4.若涉及非法交易，还需向公安机关报案，追究相关人员责任。